Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot9Q9JKY0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnot9Q9JKY0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot9Q9JKY0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot9Q9JKY0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot9Q9JKY0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot9Q9JKY0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms