Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrac1Q9JKP8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrac1Q9JKP8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrac1Q9JKP8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrac1Q9JKP8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrac1Q9JKP8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrac1Q9JKP8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms