Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp39a1Q9JKJ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp39a1Q9JKJ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms