Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trem3Q9JKE1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trem3Q9JKE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trem3Q9JKE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trem3Q9JKE1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem3Q9JKE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms