Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmg1Q9JK23 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmg1Q9JK23 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmg1Q9JK23 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmg1Q9JK23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmg1Q9JK23 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmg1Q9JK23 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmg1Q9JK23 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmg1Q9JK23 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psmg1Q9JK23 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmg1Q9JK23 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmg1Q9JK23 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms