Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpd3Q9JJY3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd3Q9JJY3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd3Q9JJY3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smpd3Q9JJY3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpd3Q9JJY3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd3Q9JJY3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms