Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Caln1Q9JJG7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Caln1Q9JJG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Caln1Q9JJG7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Caln1Q9JJG7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Caln1Q9JJG7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Caln1Q9JJG7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Caln1Q9JJG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Caln1Q9JJG7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Caln1Q9JJG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Caln1Q9JJG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Caln1Q9JJG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Caln1Q9JJG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Caln1Q9JJG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Caln1Q9JJG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Caln1Q9JJG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Caln1Q9JJG7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Caln1Q9JJG7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Caln1Q9JJG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Caln1Q9JJG7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Caln1Q9JJG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,9 ms