Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpf2Q9JJ80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpf2Q9JJ80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpf2Q9JJ80 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpf2Q9JJ80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpf2Q9JJ80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpf2Q9JJ80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpf2Q9JJ80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rpf2Q9JJ80 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.2 ms