Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2ird1Q9JI57 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2ird1Q9JI57 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2ird1Q9JI57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms