Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ3

Chrm3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm3Q9ERZ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrm3Q9ERZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrm3Q9ERZ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm3Q9ERZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm3Q9ERZ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm3Q9ERZ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm3Q9ERZ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms