Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ripk4Q9ERK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ripk4Q9ERK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ripk4Q9ERK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ripk4Q9ERK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ripk4Q9ERK0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ripk4Q9ERK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ripk4Q9ERK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms