Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox9Q9EQM5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rhox9Q9EQM5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox9Q9EQM5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox9Q9EQM5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms