Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI8

Mrpl46, 39S ribosomal protein L46, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl46Q9EQI8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl46Q9EQI8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl46Q9EQI8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl46Q9EQI8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl46Q9EQI8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl46Q9EQI8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl46Q9EQI8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms