Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rpgrip1Q9EPQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms