Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrmuQ9DAT5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrmuQ9DAT5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrmuQ9DAT5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrmuQ9DAT5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrmuQ9DAT5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms