Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DAA3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DAA3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DAA3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAA3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAA3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAA3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9DAA3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAA3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAA3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9DAA3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DAA3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DAA3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms