Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd8Q9DA37 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd8Q9DA37 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd8Q9DA37 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samd8Q9DA37 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd8Q9DA37 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms