Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhc1Q9D9T8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhc1Q9D9T8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efhc1Q9D9T8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhc1Q9D9T8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms