Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TcimQ9D915 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TcimQ9D915 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TcimQ9D915 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TcimQ9D915 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms