Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sec11cQ9D8V7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec11cQ9D8V7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec11cQ9D8V7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec11cQ9D8V7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms