Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med11Q9D8C6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med11Q9D8C6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med11Q9D8C6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med11Q9D8C6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med11Q9D8C6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med11Q9D8C6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms