Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms