Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a3Q9D658 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptp4a3Q9D658 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptp4a3Q9D658 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a3Q9D658 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptp4a3Q9D658 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms