Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnbd2Q9D5U8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnbd2Q9D5U8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnbd2Q9D5U8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnbd2Q9D5U8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnbd2Q9D5U8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnbd2Q9D5U8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms