Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms