Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap53Q9D439 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cfap53Q9D439 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cfap53Q9D439 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfap53Q9D439 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap53Q9D439 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms