Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3I0

5530400C23Rik, RIKEN cDNA 5530400C23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530400C23RikQ9D3I0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
5530400C23RikQ9D3I0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
5530400C23RikQ9D3I0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
5530400C23RikQ9D3I0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
5530400C23RikQ9D3I0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5530400C23RikQ9D3I0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
5530400C23RikQ9D3I0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms