Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Trim42Q9D2H5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Trim42Q9D2H5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Trim42Q9D2H5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Trim42Q9D2H5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Trim42Q9D2H5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Trim42Q9D2H5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Trim42Q9D2H5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Trim42Q9D2H5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Trim42Q9D2H5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms