Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl53Q9D1H8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl53Q9D1H8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl53Q9D1H8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl53Q9D1H8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms