Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem53Q9D0Z3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem53Q9D0Z3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem53Q9D0Z3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms