Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Mis18aQ9CZJ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Mis18aQ9CZJ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mis18aQ9CZJ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mis18aQ9CZJ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mis18aQ9CZJ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mis18aQ9CZJ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms