Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thumpd2Q9CZB3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Thumpd2Q9CZB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Thumpd2Q9CZB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Thumpd2Q9CZB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thumpd2Q9CZB3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms