Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY58

Serbp1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serbp1Q9CY58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serbp1Q9CY58 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serbp1Q9CY58 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Serbp1Q9CY58 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serbp1Q9CY58 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serbp1Q9CY58 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serbp1Q9CY58 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serbp1Q9CY58 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serbp1Q9CY58 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Serbp1Q9CY58 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Serbp1Q9CY58 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serbp1Q9CY58 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serbp1Q9CY58 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serbp1Q9CY58 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serbp1Q9CY58 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Serbp1Q9CY58 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Serbp1Q9CY58 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serbp1Q9CY58 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms