Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChtopQ9CY57 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChtopQ9CY57 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChtopQ9CY57 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChtopQ9CY57 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms