Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Exo5Q9CXP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Exo5Q9CXP9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exo5Q9CXP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exo5Q9CXP9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms