Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnih4Q9CX13 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Cnih4Q9CX13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Cnih4Q9CX13 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Cnih4Q9CX13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih4Q9CX13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnih4Q9CX13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnih4Q9CX13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnih4Q9CX13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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