Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Snx2Q9CWK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Snx2Q9CWK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,64■■□□□ 1,38
Snx2Q9CWK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Snx2Q9CWK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Snx2Q9CWK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23,51■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,5■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Snx2Q9CWK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23,42■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Snx2Q9CWK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,6 ms