Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Snw1Q9CSN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Snw1Q9CSN1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snw1Q9CSN1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snw1Q9CSN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Snw1Q9CSN1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snw1Q9CSN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snw1Q9CSN1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snw1Q9CSN1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snw1Q9CSN1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms