Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vta1Q9CR26 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vta1Q9CR26 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Vta1Q9CR26 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vta1Q9CR26 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vta1Q9CR26 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vta1Q9CR26 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vta1Q9CR26 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Vta1Q9CR26 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vta1Q9CR26 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vta1Q9CR26 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vta1Q9CR26 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vta1Q9CR26 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms