Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufab1Q9CR21 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndufab1Q9CR21 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufab1Q9CR21 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufab1Q9CR21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufab1Q9CR21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufab1Q9CR21 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms