Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifitm3Q9CQW9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ifitm3Q9CQW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifitm3Q9CQW9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms