Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5f1Q9CQQ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5f1Q9CQQ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5f1Q9CQQ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp5f1Q9CQQ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms