Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chchd5Q9CQP3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chchd5Q9CQP3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chchd5Q9CQP3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chchd5Q9CQP3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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