Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DenrQ9CQJ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DenrQ9CQJ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DenrQ9CQJ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DenrQ9CQJ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms