Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudcd2Q9CQ48 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd2Q9CQ48 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd2Q9CQ48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd2Q9CQ48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms