Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP9

Trim16, Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16Q99PP9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim16Q99PP9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim16Q99PP9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim16Q99PP9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim16Q99PP9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim16Q99PP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim16Q99PP9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim16Q99PP9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim16Q99PP9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim16Q99PP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim16Q99PP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim16Q99PP9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim16Q99PP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim16Q99PP9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim16Q99PP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms