Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scd3Q99PL7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scd3Q99PL7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd3Q99PL7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd3Q99PL7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scd3Q99PL7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms