Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcam1Q99NB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcam1Q99NB3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcam1Q99NB3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcam1Q99NB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcam1Q99NB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcam1Q99NB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcam1Q99NB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcam1Q99NB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcam1Q99NB3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms