Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acss1Q99NB1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acss1Q99NB1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acss1Q99NB1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acss1Q99NB1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acss1Q99NB1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acss1Q99NB1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acss1Q99NB1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms