Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpgs1Q99MS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpgs1Q99MS8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpgs1Q99MS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpgs1Q99MS8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpgs1Q99MS8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpgs1Q99MS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpgs1Q99MS8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms